Coordenado pelo professor Luiz Henrique Castelan Carlson, o curso de Engenharia de Alimentos foi implantado em 2002 e já formou duas turmas. Neste semestre são 77 acadêmicos que cumprem as atividades acadêmicas pela manhã (turno do curso) e à tarde, quanto têm complementação de estudos. A grade curricular prevê 10 semestres, com ingresso no primeiro semestre letivo de cada ano. O acadêmico formado recebe o título de Bacharel em Engenharia de Alimentos. O coordenador do curso tem graduação em Engenharia de Alimentos, mestrado em Engenharia Química e doutorado em Engenharia da Produção, todos cursados na  Universidade Federal de Santa Catarina.